Visualização do projeto de restauro, Victor Hugo Mori/IPHAN

Santo Amaro da Barra Grande teve seu último projeto de restauração vislumbrado por Lúcio Costa e executado no final do século XX (1994 a 2000). O restauro está centrado numa delicada estrutura metálica, moderna e discreta, que apenas toca nas extremidades das ruínas do pavilhão central, cobrindo um vão de 40 metros. O arquiteto Victor Hugo Mori, do IPHAN, assim o descreve: "O desenho espacial concebido em aço Cos-Ar-Cor, revela a obediência aos termos da Carta de Veneza (1964), quando prescreve: 'todo trabalho complementar reconhecido como indispensável por razões estéticas ou técnicas, destacar-se-á da composição arquitetônica e deverá ostentar a marca do nosso tempo' ".