Mapa do Brasil com a divisão em capitanias, c. 1590 (detalhe);
original da Biblioteca da Ajuda, Lisboa, cópia cedida pelo IPHAN, SP

Em 1580, Felipe II, rei da Espanha, ascendeu ao trono português, ampliando um vasto império que permaneceu unido até 1640. Piratas e corsários de reinos inimigos fustigavam os domínios e as rotas comerciais da coroa espanhola, obrigando-a a fortificar suas cidades, vilas e feitorias prósperas nas colônias ultramarinas.

Em 1584, por ordem régia de Felipe II, ergueu-se na embocadura do estuário de Santos a Fortaleza de Santo Amaro da Barra Grande, com projeto de Giovanni Battista (Juan Bautista)Antonelli, arquiteto militar que acompanhava a esquadra espanhola do Almirante Diogo Flores Valdez. A esquadra, com 16 navios, tinha por missão patrulhar a costa leste do Novo Mundo, ao sul do Equador, e fortificar o Estreito de Magalhães.